高難易度で初見クリアしたいという欲求が無ければ、カルコサ・モディファイアのプロテクションを発動させて、ゲームの難易度を下げるのがクリアには手っ取り早いかなと思いました。
というのも、カルコサ・モディファイアで難易度を下げたとしても、特にデメリットが無いからです。
また、カルコサ・モディファイアは、単純に難易度を下げるだけでなく、トライアルのマイナスの効果を受けつつ、プロテクションのプラスの効果の恩恵を得るということも可能。
例えば、発射体からのコラプション蓄積値が増加する、コラプション濃縮（トライアル）というマイナス効果を発動させて、その分、ダメージがアップするダメージ増強（プロテクション）のレベルをアップするといった形。
なので、ちょこちょことバランスを調整するのがおすすめです。
序盤については、やはりダメージ増強をオンにしておくのが単純に良いかなと思います。
敵を倒しやすくなれば、その分、敵の攻撃の激しさが減るので、ダメージを受けにくくなりますし、基本、周回をすることが多くなると思うので、より早く周回することを考えても、ダメージ増強はメリットが大きいかなと。